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El club afrontó la bancarrota en 1902, siendo rescatado por John Henry Davies del cual se dice que conoció al club porque su perro se escapó a los entrenamientos del Newton Heath y el fue quién pagó las deudas del equipo y cambió el nombre a Manchester United, además de cambiar los colores de oro y verde. Con su nuevo nombre, ganaron la liga en 1908 y la FA Cup el 26 de abril de 1909 contra el Bristol City en Crystal Palace. Con la ayuda financiera de Davies, el United se mudó de Bank Street a un nuevo estadio en Old Trafford en 1910. Ganaron la liga por segunda vez en 1911.

Matt Busby fue nombrado entrenador en 1942, y realizó un trabajo por entonces inaudito al hacer que los jugadores realicen tareas administrativas. Fue un éxito inmediato, con el club finalizando segundo en 1947 y ganando la FA Cup en 1948.
 
Busby adoptó la política de hacer jugar a los juveniles siempre que sea posible. El United ganó la liga en 1956 con una edad media en la plantilla de 22 años. Esta política se ha hecho ahora fundamental en el éxito de los equipos. A la temporada siguiente, se llevaron de nuevo la liga y finalizaron subcampeones de la FA Cup tras perder con el Aston Villa en la final. También se convirtieron en el primer equipo inglés en competir en la Copa de Europa, siendo eliminados en las semifinales.

La tragedia golpeó duramente al equipo la temporada siguiente, cuando el avión que los transportaba a casa tras un encuentro europeo se estrelló en Múnich, matando a ocho jugadores y a otros quince pasajeros. Mientras Busby se recuperaba de las heridas, Jimmy Murphy tomó las riendas del equipo, y el United continuó jugando por entonces con un equipo provisional, con el que logró jugar cara a cara al AC Milan en las semifinales de la Copa de Europa, ganándoles 2-1 en la ida aunque luego serían eliminados. Tras la desgracia, llegaron a la final de la FA Cup, perdiéndola con el Bolton Wanderers.

Busby empezó a reconstruir el equipo en los años 60, fichando a jugadores como Denis Law y Pat Crerand. Ganaron la FA Cup en 1963, la liga en 1965 y 1967, y la Copa de Europa en 1968, siendo el primer conjunto inglés en hacerlo. En esos años el equipo contaba con tres Balones de Oro: Bobby Charlton, Denis Law y George Best. Busby renunció en 1969 siendo reemplazado por Wilf McGuinness, antiguo jugador del United y entrenador del equipo de reservas.

El equipo luchó para reemplazar a Busby, y el equipo contó con Wilf McGuinness y con Frank O'Farrell, antes de contratar como entrenador a Tommy Docherty en 1972. Docherty salvó al equipo del descenso esa temporada, pero descendió en 1974. El ManU ascendió en su primer intento y llegaron a la final de la Copa de Inglaterra en 1976, pero fueron derrotados por el Southampton FC. El Manchester llegaría nuevamente a la final en 1977, derrotando al Liverpool FC. A pesar de los grandes éxitos, y su popularidad con los aficionados, Docherty fue despedido después de la final cuando se supo que tenía un romance con la esposa del fisioterapeuta.

El entrenador Ron Atkinson rompió el récord de transferencias británico al contratar a Bryan Robson del West Bromwich Albion. También se contratarían a otros nuevos jugadores como Jesper Olsen y Gordon Strachan, que jugarían junto con Norman Witheside y Mark Hughes, ambos jugadores provenientes de las inferiores del club. El United ganaría la Copa de Inglaterra en 1983 y en 1985 y eran los favoritos para ganar la Football League First Division en la temporada 1985-86 después de ganar sus diez primeros partidos, llevando diez puntos de ventaja sobre sus rivales desde octubre. El equipo luego decayó y terminó la temporada en cuarto lugar. El mal juego continuó a la temporada siguiente, y con el United al borde la zona de descenso de la liga, Atkison era removido de su puesto.

Alex Ferguson llegó del Aberdeen FC para substituir a Atkinson y guió al equipo a la 11º posición al final de la temporada. La temporada siguiente (1986-87), el equipo acabaría en segundo lugar, con Brian McClair convirtiéndose en el primer jugador en anotar más de veinte goles en una temporada después de George Best.

La llegada de Éric Cantona en noviembre de 1992 proporcionó la chispa crucial para el Manchester United, que junto al experimentado talento de jugadores como Gary Pallister, Denis Irwin y Paul Ince, así como de nuevos talentos como Ryan Giggs, Paul Scholes, hizo al United ganar un sinfín de títulos.